宏基因组测序:未知病原微生物研究的利器

当前,新型冠状病毒感染仍在全球流行,猴痘、埃博拉等一系列突发传染性疾病也在危害全球公众健康。如何及时准确地实现对新发、突发或罕见病原体的检测是我们面临的严峻挑战。


传统微生物学诊断技术受时效性、准确性及有限病原体检测范围的限制,难以满足临床复杂多变的病原体检测需求。宏基因组高通量测序(Metagenomics Sequencing,mNGS)技术是对标本中全部核酸进行高通量测序,并通过生物信息学分析以识别标本中病原体的检测方法。它尤其擅长鉴别罕见、新发、难以检测和混合感染的病原体。

样本中的核酸种类

mNGS广泛的病原体检测谱和发现未知病原体的能力使其成为新发、突发传染病的有效检测工具。2019年底,我国学者就是借助mNGS技术,仅仅数天时间就确认新冠肺炎是由一种新的冠状病毒引起的呼吸道传染性疾病,而2003年确认SARS的病原时,我们用了5个月的时间。
mNGS技术凭借不依赖传统微生物培养、病原体覆盖广及无须预先假设存在的病原体等优势,已成功应用于多种类型临床感染性疾病的病原体诊断,新发、突发传染病的调查,耐药基因检测以及宿主免疫应答分析等领域。mNGS能够一次检测出所有潜在的病原微生物,可能比一系列的传统微生物学检测更具成本效益。

产品介绍

北京微未来自主知识产权的 ULSEN® 超灵敏未知病原捕获建库测序解决方案是利用高通量测序技术检测生物体内的“ 感染组 ”,如 RNA 病毒、DNA 病毒、细菌、真核生物等。

宏基因组测序实验流程

ULSEN® 超灵敏未知病原捕获建库试剂盒

ULSEN® 超灵敏未知病原捕获建库试剂盒不仅可以检测,而且还能揭示病原体丰度、变异情况、基因表达等信息,从样本制备到数据分析可一站式完成,给应急样本检测带来便利。

产品特点:

  • 操作简单,建库流程小于 5 个小时;
  • 可在同次运行中同时开展 RNA、DNA 测序;
  • 可对低起始量的样本进行有效检测(200pg);
  • 兼容Illumina 、Nanopore、Element biosciences测序平台;
  • 支持病原微生物全序列测定;
  • 支持多种病原体同时检测;
  • 可去除核糖体RNA。

未知病原基因组测序分析软件

北京微未来专门针对未知病原捕获建库试剂盒自主知识产权研发了未知病原宏基因组测序数据分析的MicroSpectrum Analyzer® 未知病原体基因组测序快速分析软件,可以对未知病原捕获建库试剂盒的下机数据进行数据分析。分析结果列表可以展示测序数据质量、病原reads数、覆盖度、耐药基因和毒力基因注释等信息,还能让用户自定义一些重要功能。

产品特点:
  • 对下机数据一键式处理, 操作简单,无需生信背景;
  • 采用较先进的算法,分析速度快;
  • 有效排除假阳性,保留阳性结果;
  • 内置排序,筛选,导出, 统计等功能,可进行分类学统计分析;
  • 兼容Illumina 、Nanopore、Element biosciences 测序平台下机数据;
  • 检测病毒数量≥ 8000 种,细菌≥9000 种,真菌和支原体≥1000 种。

可视化物种进化树图

可视化病原微生物丰度图,代表病原体在微生物组群的相对含量


北京微未来未知病原解决方案也广泛的应用在各地疾控的日常监测工作中,同时也有一些期刊文献使用了北京微未来的解决方案。

疾病监测2021年6月30日第36卷第6期《宏基因组测序在腹泻暴发调查中的应用》

郑州大学学报(医学版)2021年9月第56卷第5期《新型冠状病毒肺炎合并感染Ⅰ型单纯疱疹病毒的诊断》


产品订购信息


北京微未来专注于病原微生物领域的新一代基因测序完整解决方案, 研发和转化了一系列具有广泛应用前景的病原微生物基因捕获试剂盒、基因测序技术和生物信息分析平台。解码病原微生物,致力传染病防控,是我们“微未来”的企业使命。

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